CBCA est membre de l’Église du Christ au Congo (ECC) et cofondatrice de la Mission évangélique unie (MEU) d’Allemagne. Elle coopère principalement avec Pain pour le Monde, le service des Églises évangéliques pour le développement, en Allemagne (EED), la Conférence des Églises de toute l’Afrique (AACC), l’Alliance baptiste mondiale (BWA), le ministère baptiste canadien (CBM), Christian Aid, la Fondation Kivu , la Fondation Lück & Gabrielle, le Fonds André Ryckmans et toute autre église ou institution qui poursuit des objectifs en ligne avec ceux de la LCSA. Depuis juin 2018, la CBCA s’est jointe au Conseil œcuménique de l’ Église .